Protein–RNA interactions for Protein: A1L0T3

Ssc4d, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc4dA1L0T3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssc4dA1L0T3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms