Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Trbv19A0A0B4J1H4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Trbv19A0A0B4J1H4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Trbv19A0A0B4J1H4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Trbv19A0A0B4J1H4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trbv19A0A0B4J1H4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv19A0A0B4J1H4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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