Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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