Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trbv1A0A0B4J1G7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trbv1A0A0B4J1G7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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