Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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