Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vstm4T1NXB5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm4T1NXB5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms