Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms