Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccne2Q9Z238 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccne2Q9Z238 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms