Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Trip6Q9Z1Y4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip6Q9Z1Y4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip6Q9Z1Y4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip6Q9Z1Y4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip6Q9Z1Y4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip6Q9Z1Y4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip6Q9Z1Y4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip6Q9Z1Y4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip6Q9Z1Y4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip6Q9Z1Y4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip6Q9Z1Y4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trip6Q9Z1Y4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms