Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms