Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfkbiaQ9Z1E3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms