Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Setbp1Q9Z180 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Setbp1Q9Z180 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms