Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn13Q9Z0S4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms