Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Katna1Q9WV86 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms