Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VapaQ9WV55 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms