Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skp1Q9WTX5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skp1Q9WTX5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms