Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PplQ9R269 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PplQ9R269 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PplQ9R269 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PplQ9R269 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PplQ9R269 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PplQ9R269 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PplQ9R269 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PplQ9R269 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PplQ9R269 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PplQ9R269 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PplQ9R269 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PplQ9R269 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PplQ9R269 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms