Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc2Q9R244 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc2Q9R244 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms