Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim3Q9R1R2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms