Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubd1Q9R1K7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubd1Q9R1K7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms