Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms