Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms