Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11cQ9QZW0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms