Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Npas3Q9QZQ0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms