Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms