Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ubxn8Q9QZ49 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms