Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tomm40Q9QYA2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tomm40Q9QYA2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms