Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nufip1Q9QXX8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nufip1Q9QXX8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms