Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpsf3Q9QXK7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpsf3Q9QXK7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms