Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rai2Q9QVY8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms