Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms