Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnaja4Q9JMC3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnaja4Q9JMC3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms