Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrfQ9JM73 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms