Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Higd1aQ9JLR9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Higd1aQ9JLR9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Higd1aQ9JLR9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Higd1aQ9JLR9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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