Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Tgm1Q9JLF6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Tgm1Q9JLF6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Tgm1Q9JLF6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Tgm1Q9JLF6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tgm1Q9JLF6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tgm1Q9JLF6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tgm1Q9JLF6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm1Q9JLF6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms