Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms