Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msgn1Q9JK54 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msgn1Q9JK54 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms