Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efcc1Q9JJF6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efcc1Q9JJF6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms