Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms