Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird1Q9JI57 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2ird1Q9JI57 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms