Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtaQ9JHK4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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