Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Htr3bQ9JHJ5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms