Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmod3Q9JHJ0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmod3Q9JHJ0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms