Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ush1cQ9ES64 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms