Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb3Q9ERD7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms