Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slco1c1Q9ERB5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms