Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dap3Q9ER88 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dap3Q9ER88 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms