Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Barx1Q9ER42 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Barx1Q9ER42 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms