Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpsf1Q9EPU4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cpsf1Q9EPU4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms