Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp1aQ9EPL5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms